它们并没有被包括在现有的分类系统里，共分为四类：
a) 非典型的子宫内膜异位症：
经过多年的观察，专科医生才知道除了典型的黑色肿块的子宫内膜异位症外，它还以其他的形态出现。如腹腔镜检查的子宫内膜异位症不仔细去观察就可能发生错误的诊断。非典型的子宫内膜异位症它最常见的形态是白色硬块的疤痕，再接下去是泡沫状的发亮疤痕。看到这些非典型的疤痕，医生更应该详细观察其它的腹膜部分，以确定没有遗漏其它的子宫内膜异位症。
b) 显微的子宫内膜异位症：
子宫内膜异位症的特点是症状的复发性，而复发的机会因岁月而增加，根据一项报告指出复发的机会要3年内是14%，到3、5年之后，复发的机会已升到了40%。这又是为什么呢？在做手术的一般医生都想把子宫内膜异位症切除，就是把它烧灼了，可是为什么又会有那么多的复发病症呢。所谓复发一个原因可能是体内另外新生长的子宫内膜异位症；另一个可能是在手术时并没有发现非典型的子宫内膜异位症，或者是显微的子宫内膜异位症，在不孕的病人之中，55%有这种非典型的子宫内膜异位症，如果没有发现非典型的子宫内膜异位症或显微的子宫内膜异位症，那么手术就不可能做的完整，结果是手术后会继续产生疼痛和不孕。这可能是手术没有完全消化子宫内膜异位症而产生了更多和更活跃的前列腺素而导致疾病的复发。
c) 腹膜下的疾病：
这种子宫内膜异位症是从腹膜下生长，慢慢侵入腹膜之下组织亚伦与马斯特斯医生早在1955年发现此病产生后的妇女如果盆腔组织受到损伤，这层腹膜产生缺陷，并产生疼痛，这种腹膜缺陷也因此命名为“亚伦马氏综合症”。在此病患者中有50%会出现这种症状，这些缺陷呈现多种形状。最常见的形状是洞形，有腹腔镜可以很清楚的看到。差不多所有的患病者的腹膜如果有缺陷的话，都会有严重的下腹疼痛的病症。特别是痛经，性交疼或慢性下腹疼痛。从理论上说子宫内膜异位症造成腹膜下层组织破损，结痂，刺激表层的变化而造成这些缺陷，医生们应该提醒自己，病人可能隐藏着这种病应积极治疗。
d) 严重的子宫内膜异位症（末期）
所谓严重的子宫内膜异位症，是指疾病侵入了卵巢，子宫直肠凹陷的部位或子宫膀胱之间的位置，它往往是妇女产生疼痛的最主要的原因。此病症可以两种形式出现：最常见的一种症状是卵巢肿瘤及粘连，这是子宫内膜附在卵巢上，通常称它为“卵巢巧克力囊肿”，因为它里面含有每次月经周期所流的经血如同巧克力状。使用荷尔蒙通常不会消除这些肿瘤，有时反而会使它破裂，所以医生只能采取手术的方法，但手术也难免它不复发；另一种是痛经加剧后，还有性交痛，便秘。妇检时可触之子宫直肠之间的肿块。如病症加剧或出现新的问题就必须马上找内行的医生及时处理，少走弯路。
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